深圳社保不能自动扣款的原因可能有以下几点：

1. 社保系统升级 ：深圳的社保系统可能正在进行升级，导致银行无法自动从银行卡中扣除社保费用。

2. 账户余额不足 ：如果社保账户余额不足，可能会导致社保停止自动扣款。建议前往当地社保局窗口查询社保账户余额，并及时进行缴纳。

3. 社保业务终止或暂停 ：如果社保业务已经终止或者暂停，可能会导致社保停止自动扣款。可以前往当地社保局窗口咨询，了解具体的业务情况，并进行恢复申请。

4. 社保账号信息变更 ：如果社保账号信息发生变更，例如银行卡号、手机号码等，可能会导致社保停止自动扣款。可以前往当地社保局窗口进行修改，确保社保账号信息的准确性。

5. 银行状态异常 ：如果金融社保卡处于未激活、挂失、注销、冻结等银行状态异常情况下，都是无法扣费的。

6. 扣款时间未至 ：社保扣款时间是每月22日或月底最后一天扣费，个缴人员要每月22日前在缴纳社保费账户中存入足够金额。如果账户里没有存够钱，将会扣款失败。

7. 系统故障或维护 ：偶尔系统可能会出现故障或者维护，导致自动扣款无法进行。这种情况下，可以稍后再尝试扣款，或者联系社保局了解具体情况。

建议您根据以上原因，逐一排查并解决问题，以确保社保能够按时自动扣款。如果仍有疑问，可以直接联系当地社保局或通过官方渠道获取最新信息。