选择治疗疲劳的医院时，建议考虑以下几个因素：

1. 医院的专业水平：选择在治疗疲劳方面有丰富经验和专业知识的医院。这可以通过查看医院的科室设置、医生团队的专业背景和研究成果来了解。
2. 医院的设备和技术：先进的医疗设备和技术可以提供更准确的诊断和更有效的治疗。选择拥有先进设备的医院可能更为合适。
3. 医院的口碑和评价：通过查看医院的口碑和患者的评价，可以了解医院的服务质量、治疗效果和患者满意度等方面的信息。
4. 医院的地理位置和交通便利性：选择离家较近或交通便利的医院，可以方便患者的就诊和复诊。

在江苏南京，有几家医院在治疗疲劳方面有较好的口碑和专业水平，包括：

1. 江苏省人民医院：作为江苏省内的综合三甲医院，江苏省人民医院拥有多个专科门诊，包括内分泌科、神经内科等，可以为患者提供全面的诊断和治疗。
2. 南京鼓楼医院：南京鼓楼医院是一家历史悠久的综合医院，拥有多个专科门诊，包括内分泌科、心理科等，可以为患者提供个性化的治疗方案。
3. 南京脑科医院：南京脑科医院是一家专科医院，专注于神经系统疾病的诊断和治疗，包括疲劳综合征等。

以上医院仅供参考，具体选择应根据个人情况和需求来决定。如果您有特定的需求或疑问，建议直接联系医院或咨询专业医生的意见。