脊髓亚急性联合变性如果不治疗，会导致严重的神经系统损伤和功能障碍，甚至危及生命，具体如下：
- 运动障碍：患者会出现双下肢进行性无力、发硬，双手动作笨拙，随着病情发展，可出现不完全性痉挛性瘫痪，表现为肢体无力、行走困难、平衡失调，最终可能完全瘫痪，导致患者无法独立生活。
- 感觉异常：脊髓后索受损，患者会出现双下肢震动觉、位置觉减退或缺失，有走路踩棉花感，闭目或在黑暗中行走困难，还可能出现感觉性共济失调，易跌倒。周围神经受损会导致对称性四肢末端感觉异常，如刺痛、麻木和烧灼感等，感觉像戴了手套、穿了袜子。病情严重时，会发展为感觉减退或消失，严重影响生活质量。
- 自主神经功能障碍：少数患者晚期会出现括约肌功能障碍，表现为排便异常、排尿异常，如大小便失禁等，还可能出现性功能障碍。
- 精神症状：部分患者会出现精神异常，如易激惹、抑郁、幻觉、精神错乱、类偏执狂倾向，认知功能减退甚至痴呆，从而影响患者的心理健康和日常生活能力。
- 其他并发症：由于维生素 B₁₂缺乏，患者还容易发生贫血，可出现倦怠、无力、心慌、头昏等症状。随着病情进展，可能引发贫血性心脏病、心力衰竭等。患者因长期卧床，还可能出现肺部感染、深静脉血栓形成、压疮等并发症，这些都可能危及生命。
