医保断缴三个月时，累计缴费年限不会清零，但连续缴费年限会重新计算。具体说明如下：

一、累计缴费年限与连续缴费年限的区别

1. 累计缴费年限

   按实际缴费时间累计计算，允许中断后补缴。例如，某人缴费20年，中途断缴3年，断缴后补缴年限可继续累计，总年限仍为20年。

2. 连续缴费年限

   需保持不间断缴纳，断缴超过3个月将重新计算。例如，断缴3年后补缴，需连续缴费满6个月才能恢复医保报销资格，且退休时累计年限从零开始计算。

二、断缴3个月内的处理方式

• 补缴后恢复待遇 ：断缴3个月内补缴，次月可恢复医保报销资格，无需重新计算等待期，但需承担滞纳金。

三、断缴超过3个月的影响

• 报销资格 ：断缴超过3个月需重新连续缴费6个月才能恢复报销，期间无法享受医保待遇。

• 个人账户 ：断缴期间个人账户余额可继续使用，但住院费用需自费。

四、其他注意事项

• 养老金计算 ：累计缴费年限清零仅适用于养老保险，医保断缴不影响养老金计算。

• 生育险等特殊险种 ：如生育险需连续缴费满1年，断缴可能影响报销。

建议尽量保持医保连续缴纳，避免因断缴影响长期医疗保障权益。若已断缴，应尽快补缴或咨询当地社保部门了解过渡方案。