社保医保一个月被扣除两次，通常由以下原因导致，需结合具体情况判断：

一、常见原因分析

1. 基数调整补扣

   当社保缴费基数调整时，系统可能需补扣上个月未调整的差额。例如，某月工资基数上涨，但系统未及时更新，导致次月出现重复扣款。

2. 上月漏扣补扣

   若上月因缴费基数计算错误、银行代扣失败或系统故障未成功扣款，本月会进行补扣。

3. 参保时间差异

   新参保人员从当月参保次月开始，系统会预扣当月开始和次月的社保费用。

4. 银行卡信息错误

   代扣银行卡信息填写错误，可能同时扣除本人及他人（如家属）的社保费用。

5. 系统或数据重复

   地税部门与银行数据传输错误，或银行系统重复发送扣款指令。

二、处理建议

1. 核对缴费信息

   通过社保中心或银行APP查询缴费明细，确认是否因基数调整或漏扣导致重复扣款。

2. 检查银行卡绑定

   确认代扣银行卡仅绑定本人社保账户，避免误扣他人费用。

3. 联系扣费单位

   若怀疑系统错误，可联系社保机构或银行客服，提供缴费凭证申请退错扣款。

4. 关注缴费基数调整通知

   基数调整通常每年固定时间进行，关注单位通知避免因基数变动引发重复扣款。

三、法律依据

根据《中华人民共和国社会保险法》第六十三条规定，用人单位未足额缴纳社保时，社保机构会责令限期补缴。若因单位原因导致重复扣款，可通过法律途径维护权益。

以上情况需结合实际缴费记录和系统反馈综合判断，建议优先通过官方渠道核实信息。