医保有缴费记录但是没有余额的原因如下：
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信息错误：有时候，个人的医保信息可能存在错误，例如姓名、身份证号码等信息与医保系统中的记录不符，导致无法正常查询余额。
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只缴纳了养老保险：如果个人自行参加灵活就业社保或城乡居民社保时，只缴纳了灵活就业养老保险或城乡居民养老保险保费，而没有缴纳灵活就业医保或城乡居民医保保费，那么自然也无法查询到医保卡余额。
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查询方式错误：有的参保人可能会误将社保卡金融账户余额当做医保卡个人账户余额进行查询，但是社保卡金融账户一般还需要激活后自己往里面存钱了，才会显示有余额，就像是银行卡一样，若没有自己存钱，那么自然是查询不到余额的。 而若是需要查询医保卡个人账户余额，一般可以拨打当地社保官方服务热线进行查询，或者在社保官网、社保官方公众号等渠道查询。
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医保机构还未划账：如果你拿到医保卡的时间还不长，查余额时显示为零，那么可能是医保经办机构还未正式划账，耐心等待几天就可以了，如果还是没有的话，可以打电话给12333询问。
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新参保人员：个人医保账户金额还没有划入，余额就显示为0，有的城市需要缴纳三个月后，才会划入的。
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医保卡没有激活：社保卡没有激活，也是无法正常查询社保卡余额的。
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医保缴纳的档次不同：医保有几个档次，参保档次不同。比如缴纳的深圳社保是第二三档医保，因为只有参加深圳医保一档，才拥有医保个人账户，深圳二三档医保是没有医保个人账户的。
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交的城乡居民医保：城乡居民医保是不建立个人医保账户的，余额是0的。
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系统延迟：当月缴纳社保后，在扣缴成功以后还需要一定的工作日时间才能到账的，系统会产生延迟，就是公司已经扣了，但是网上却没有余额的情况。
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公司还没有进行代缴：在通过社保官网查询后，如果没有查到，显示余额为0，也可能是公司还没有进行社保的代扣，可以找公司的社保负责人问问。
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医保卡里没有余额：公司交了医保，会有部分进入到个人账户当中，有可能是账户里的金额用完了。因此会显示没有余额。
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灵活就业人员参保：如果是用灵活就业人员参保的话，一般是没有个人账户，就会显示余额。
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个人账户的钱用完了：职工医保有个人账户和统筹账户之分，只有当医保卡个人账户中有钱时，参保人才可以通过指定渠道查询到。 若是医保个人账户中的钱已经用完了，那么查询的时候自然会显示余额为零。
如果您遇到医保有缴费记录但是没有余额的情况，请先核对您的缴费信息和个人信息是否正确，并尝试通过正确的渠道查询余额。如果问题依然存在，建议您联系当地社保局或医保机构寻求帮助。
