结缔组织性肠炎是否会影响入职，需要根据具体的工作类型和体检标准来确定。以下是一些可能的情况：

1. 公务员和事业单位

根据相关规定，各种弥漫性结缔组织疾病，包括红斑狼疮、皮肌炎、硬皮病、结节性多动脉炎、类风湿性关节炎等，在公务员和事业单位的体检中是不合格的13。如果患有结缔组织性肠炎，并且被归类为弥漫性结缔组织疾病，那么可能会影响入职。

2. 一般企业

对于一般企业的入职体检，通常不会对结缔组织性肠炎进行特别的检查。只要该疾病不影响正常工作，并且不具有传染性，一般不会影响入职4。

3. 特殊行业

对于一些特殊行业，如警察、军队等，体检标准可能会更加严格。这些行业可能会对结缔组织疾病进行筛查，并可能因此影响入职9。

4. 疾病控制

如果结缔组织性肠炎得到良好控制，并且不影响正常工作，那么在大多数情况下，不会影响入职。具体的入职体检标准可能会因地区和行业而异，因此最好在入职前咨询相关单位或医生，了解具体的体检要求。

5. 入职体检项目

入职体检通常包括血常规、尿常规、肝功能、肾功能、乙肝表面抗原等基本检查项目。这些检查项目一般不会直接检测出结缔组织疾病，但如果有相关症状或体征，可能会引起医生的注意，并进行进一步的检查12。

结缔组织性肠炎是否会影响入职，取决于具体的工作类型、体检标准以及疾病的控制情况。如果您有相关疑问，建议咨询相关单位或医生，以获取准确的信息。