等孢球虫病的治疗主要包括以下几种方法：

药物治疗

1. 复方磺胺甲噁唑（TMP/SMX）：这是治疗等孢球虫病的首选药物。成人剂量为TMP 160mg加SMX 800mg，每天两次，连服7～10天。儿童剂量为TMP 5 mg/kg及SMX 25 mg/kg，每天两次，疗程同成人。

2. 乙胺嘧啶：对于对TMP/SMX过敏或不耐受的患者，可以使用乙胺嘧啶治疗。成人每日典型剂量为50~75mg。为了帮助防止骨髓抑制，使用乙胺嘧啶治疗的患者被给予甲酰四氢叶酸。

3. 环丙沙星：环丙沙星500mg，每天两次，连服7天，也用于治疗等孢球虫病，但疗效不及TMP-SMX。

4. 其他药物：如阿苯达唑、阿奇霉素、萘啶酸等也可以根据具体情况使用。

支持性治疗

1. 补充水分和电解质：等孢球虫病常引起腹泻和脱水，需要大量饮水或使用口服补液盐来补充体液。

2. 营养支持：确保摄入足够的营养，特别是维生素和矿物质，以帮助恢复体力和免疫功能。

预防措施

1. 保持良好的个人卫生：勤洗手，尤其是在饭前便后。

2. 避免饮用未经处理的水：建议饮用烧开的水或瓶装水。

3. 妥善处理食物：避免食用生的或未煮熟的食品，尤其是海产品和蔬菜，应彻底清洗和烹煮。

4. 环境卫生：确保生活环境和公共设施的清洁，防止交叉污染。

在治疗过程中应严格遵循医生的建议，合理调整用药时间和剂量。还需注意长期保持良好的卫生习惯，预防再次感染。如果有持续高热或其他异常症状应及时就医。