个体户食品经营许可证过期三个月属于违法行为，需要立即采取措施以避免更严重的法律后果和经营风险。根据相关法律法规的规定，以下是详细的处理步骤：
立即停止食品经营活动
您应当立即停止任何涉及食品销售的经营活动，因为继续经营将被视为无证经营，这可能会导致罚款或其他行政处罚。
准备申请材料并提交补办或延期申请
接下来，您需要准备一系列必要的文件，并向原发证机关提出补办或延期申请。通常情况下，这些文件包括但不限于：
- 《食品经营许可延续申请书》；
- 营业执照副本或其他主体资格证明文件复印件；
- 法定代表人身份证明；
- 原食品经营许可证正本、副本；
- 与食品经营相适应的主要设备设施布局及操作流程等资料；
- 食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度。
请注意，如果您的经营条件没有发生变化，相关部门可以不再进行现场核查。但是，若经营条件有所变化，则可能需要进行现场检查以确认是否符合食品安全标准。
接受审查并配合整改
一旦提交了所有必需的文件，食品药品监督管理部门会对您的申请进行审核。在此期间，您可能需要提供额外的信息或者对发现的问题进行整改。确保及时响应监管机构的要求，并按照指示完成所有必要的改进工作。
缴纳罚款（如有）
如果在许可证过期期间有从事经营活动的行为，可能会面临罚款等行政处罚。具体的处罚金额会依据违法所得的情况而定。例如，货值金额不足一万元的，并处二千元以上五万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额五倍以上十倍以下罚款。因此，在此阶段，您应积极配合监管部门缴纳相应的罚款。
获取新的许可证
完成上述步骤并通过审核后，您将获得新的食品经营许可证。此时，您可以重新开始合法地开展食品经营活动。务必记住，新的许可证有效期同样为五年，且编号保持不变。同时，为了防止未来再次发生类似情况，请定期关注许可证的有效期限，并提前做好续期准备。
面对食品经营许可证过期的问题时，最重要的是迅速行动，遵循正确的程序来解决问题，这样才能最大程度减少对业务的影响，并确保遵守法律法规的要求。如果您不确定具体的操作流程或遇到困难，建议咨询专业律师或直接联系当地食品药品监督管理部门获取帮助。
