2025年，在西藏昌都地区治疗头痛的医院有多个选择，以下是一些推荐的医疗机构：

1. 昌都地区人民医院：作为昌都地区规模较大的综合型公立医院之一，昌都地区人民医院提供了全面的医疗服务，包括神经内科，这是治疗头痛的主要科室。该医院不仅拥有先进的医疗设备，还有一支经验丰富的医疗团队，能够为患者提供高质量的诊疗服务。

2. 昌都地区中医院：对于倾向于中医治疗的患者，昌都地区中医院也是一个不错的选择。这里可以提供中药、针灸等传统治疗方法来缓解头痛症状。

3. 昌都市藏医院：这是一家集医疗、预防、保健、教学、科研以及藏药生产销售为一体的三级乙等民族医医院。临床以藏医诊疗为主，结合西医辅助检查治疗。如果考虑使用藏医药物或疗法治疗头痛，可以选择这家医院。

4. 西藏自治区人民医院：虽然位于拉萨，但作为西藏地区规模最大的三级甲等综合型公立医院，它同样为昌都地区的居民提供远程医疗服务，并且在处理复杂的头痛病例方面有着丰富的经验。

5. 中国人民解放军西藏军区总医院：这也是一家三级甲等医院，擅长处理各种神经系统疾病，包括头痛。该医院的医生团队具备处理复杂病例的能力，能够为患者提供专业的治疗方案。

6. 昌都协和医院：这是一家经国家卫生主管部门批准成立的大型综合性医院，拥有多种现代化医疗设备，如核磁共振、CT等，可进行详细的检查以确定头痛的原因，并据此制定个性化的治疗计划。

7. 昌都癫痫病医院：尽管主要专注于癫痫的治疗，但该医院在神经科领域也有一定的专长，对于某些类型的头痛（例如由神经系统问题引起的）可能提供有效的治疗。

请注意，上述信息基于最新可用的数据，但是具体到哪家医院最适合您的情况，还需要根据您的具体情况（如头痛类型、个人健康状况等）以及最新的医院服务信息来做决定。建议您在选择医院前，先通过电话咨询或者在线问诊的方式与相关医院联系，了解更详细的信息和服务内容。考虑到医疗资源的变化，最好直接联系医院确认其当前的服务能力和专家出诊情况。