开水消毒不能杀死所有细菌。
开水消毒的原理是利用高温使细菌的蛋白质变性，破坏细菌的细胞结构和功能，从而达到杀菌的目的。一般来说，将水加热到 100℃并保持一定时间，可以杀灭大部分细菌。例如，常见的大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等在开水中较容易被杀灭。仍有一些细菌或其特殊形态对高温有较强的抵抗力，开水消毒难以将它们全部杀死，具体如下：
- 耐热菌：像李斯特氏菌能在 1-45℃范围内生长，在 - 20℃低温下仍能部分存活，60℃持续 20 分钟或 70℃持续 5 分钟才能杀死；金黄色葡萄球菌需在 80℃下持续 30 分钟才能完全被杀灭，其产生的肠毒素耐热性极强，即使 100℃下持续 30 分钟仍不会破坏。
- 细菌芽孢：芽孢是细菌在恶劣环境下形成的休眠体，耐酸、耐热、耐干，较难杀灭。例如肉毒杆菌芽孢要在 101℃下持续加热 10 分钟才能被杀灭，而炭疽芽孢、蜡样芽孢杆菌等也能耐受开水的温度，普通的开水消毒无法将它们有效杀灭。
开水消毒的效果还受到其他因素的影响，如消毒时间、消毒对象的材质和清洁程度等。要达到较好的消毒效果，需要确保水温达到 100℃并保持足够的时间，同时要注意被消毒物品的清洁，以提高开水消毒的效果。但即使在理想条件下，由于上述耐热菌和细菌芽孢的存在，开水消毒也无法保证杀死所有细菌。
