公司收取大额现金的合法性取决于多个因素，包括金额的大小、资金的来源、交易的性质以及是否遵循相关法律法规。以下是一些关键点：

1. 1.法律法规要求：根据《中华人民共和国会计法》和《中华人民共和国税收征收管理法》，企业必须确保入账资金的合法性，不得存在任何违法违规行为《现金管理暂行条例》规定了现金使用的范围和上限，企业应尽量使用转账方式支付款项，避免大额现金交易。
2. 2.资金来源审查：企业应对大额现金入账的资金来源进行严格审查，确保资金来自合法渠道。这有助于降低企业面临的法律风险，并维护企业的声誉和信誉
3. 3.财务和会计处理：大额现金入账后，企业需按照相关会计准则和财务制度进行正确的财务和会计处理，包括准确记录资金流动、合理分摊成本、及时缴纳相关税费等，以确保企业财务报告的准确性和合规性
4. 4.大额现金支付管理：根据《大额现金支付管理制度》，大额现金支付指单次支付现金人民币50万元（含）以上的款项。该制度要求大额现金支付必须符合国家法律法规及公司内部管理制度，并采用银行转账方式，严禁现金直接支付
5. 5.监管和风险控制：近年来，非现金支付快速发展，但现金需求有增无减，尤其是大额现金广泛使用，容易被腐败、偷逃税、洗钱等违法犯罪活动利用，蕴含较大风险。因此，国家对大额现金的管理越来越严格

公司收取大额现金在某些情况下是合法的，但必须严格遵守相关法律法规，确保资金的合法来源和合规性，并进行正确的财务和会计处理。如果涉及大额现金支付，建议尽量采用银行转账方式，并遵循《大额现金支付管理制度》的相关规定。