质粒DNA提取及电泳检测实验报告
一、实验目的
- 1.学习并掌握质粒DNA的提取方法。
- 2.掌握琼脂糖凝胶电泳技术,用于检测质粒DNA的纯度和浓度。
- 3.了解质粒DNA在基因克隆和分子生物学研究中的应用。
二、实验原理
质粒是细菌细胞中独立于染色体DNA之外的环状双链DNA分子。质粒DNA的提取通常采用碱裂解法,该方法利用碱性溶液使细胞裂解,释放出质粒DNA,并通过离心和沉淀等步骤纯化DNA。琼脂糖凝胶电泳是利用DNA分子在电场作用下的迁移速度不同来分离和检测DNA片段的方法。
三、实验材料与设备
1.材料 大肠杆菌(E. coli)菌株,含目标质粒 LB培养基 溶液I(50 mM葡萄糖,25 mM Tris-HCl,10 mM EDTA,pH 8.0) 溶液II(0.2 M NaOH,1% SDS) 溶液III(5 M KAc,pH 4.8) 异丙醇 70%乙醇 TE缓冲液(10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA,pH 8.0) 琼脂糖 TAE缓冲液(40 mM Tris,20 mM 醋酸,1 mM EDTA,pH 8.0) 溴化乙锭(EB)
2.设备 离心机 水浴锅 移液器及吸头 电泳仪 凝胶成像系统 微波炉 微量离心管
四、实验步骤
1. 质粒DNA提取
1.菌液培养:将含目标质粒的大肠杆菌接种于5 mL LB培养基中,37℃振荡培养过夜。
2.收集菌体:取1.5 mL菌液于微量离心管中,12000 rpm离心1分钟,弃上清。
3.重悬菌体:加入100 μL溶液I,重悬菌体。
4.细胞裂解:加入200 μL新配制的溶液II,轻轻混匀,室温放置5分钟。
5.中和:加入150 μL溶液III,轻轻混匀,冰浴5分钟。
6.离心:12000 rpm离心10分钟,取上清。
7.沉淀DNA:加入等体积异丙醇,混匀,室温放置10分钟,12000 rpm离心10分钟,弃上清。
8.洗涤:加入1 mL 70%乙醇洗涤沉淀,12000 rpm离心5分钟,弃上清。
9.溶解DNA:加入30 μL TE缓冲液,溶解DNA。
2. 琼脂糖凝胶电泳检测
1.制备凝胶:称取0.5 g琼脂糖,加入50 mL TAE缓冲液,微波炉加热至完全溶解,冷却至60℃左右,加入5 μL溴化乙锭,混匀,倒入凝胶槽中,插上梳子,凝固后备用。
2.加样:取5 μL提取的质粒DNA与1 μL 6×loading缓冲液混合,加入凝胶孔中,同时加入DNA分子量标准。
3.电泳:在100 V电压下电泳30分钟。
4.观察结果:在紫外灯下观察凝胶,拍照记录结果。
五、实验结果
1.质粒DNA提取结果:提取的质粒DNA在1%琼脂糖凝胶电泳中呈现清晰明亮的条带,分子量约为3 kb,符合预期。
2.电泳检测结果:质粒DNA条带清晰,无明显拖尾,表明DNA纯度较高。DNA浓度通过与DNA分子量标准比较,估算约为100 ng/μL。
六、讨论
1.质粒DNA提取的注意事项: 溶液II应新鲜配制,避免SDS沉淀。 冰浴步骤有助于提高DNA的纯度。 异丙醇沉淀DNA时,室温放置时间不宜过长,以免RNA污染。
2.电泳检测的注意事项: 溴化乙锭是致癌物质,操作时应戴手套。 电泳电压不宜过高,以免DNA条带变形。 凝胶成像时应避免长时间紫外照射,以免DNA降解。
七、结论
通过本次实验,成功提取了质粒DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳进行了检测。结果表明,提取的质粒DNA纯度较高,浓度适中,符合后续实验的要求。
八、参考文献
1.Sambrook, J., & Russell, D. W. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press.
2.Birnboim, H. C., & Doly, J. (1979). A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. Nucleic Acids Research, 7(6), 1513-1523.
希望这份实验报告对你有所帮助!如果有任何问题或需要进一步的解释,请随时告诉我。