电子医保卡扣费主要扣的是医保卡里的钱，扣款来源包括个人医保账户余额和医保统筹基金。以下是详细的解释：

1. 1.个人医保账户余额：医保电子凭证的扣款主要来源于个人的医保账户余额。在个人缴纳医保费用时，一部分金额会被划入个人的医保账户中，用于支付医疗费用当个人使用电子医保卡进行就医或购药时，系统会根据实际费用情况从个人的医保账户中扣除相应金额
2. 2.医保统筹基金：除了个人医保账户余额外，医保电子凭证的扣款也可能来源于医保统筹基金。医保统筹基金是由政府和参保人员共同缴纳的资金，用于支付医疗保险范围内的费用当个人的医保账户余额不足以支付全部费用时，系统会自动从医保统筹基金中补充扣款
3. 3.自费部分：如果需要个人承担的费用，按照地方规定需自己支付个人所承担的费用
4. 4.特殊情况：在一些情况下，如在药店购药或医院就诊时，扣款方式可能会有所不同。例如，在药店使用电子医保卡支付时，通常会直接从医保账户中扣除费用在医院使用电子医保卡支付时，可能需要关注医院支付宝生活号，在推送的待缴费信息中选择医保支付

总结来说，电子医保卡扣费主要来源于个人医保账户余额和医保统筹基金，具体扣款方式可能会因地区和政策的不同而有所差异。如果需要个人承担的费用，则需自行支付。