根据搜索材料和一般法律知识，网贷逾期三年后，借款人通常不能只还本金。以下是详细解释：

1. 1.合同规定：网贷合同是受法律保护的契约，借款人在合同中承诺偿还本金、利息及可能的罚息等条款
2. 2.法律角度：根据《中华人民共和国民法典》第六百七十六条的规定，借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规章支付逾期利息
3. 3.实际操作中的协商可能性：尽管法律规定明确，但在实际操作中，借款人仍有可能通过与贷款机构协商，寻求更为灵活的还款方案。例如，借款人可以通过以下方式尝试协商：主动沟通：及时与贷款机构联系，说明逾期原因并表达还款意愿提供证明材料：向贷款机构提供详细的财务状况说明、还款计划等材料，展示还款诚意和实际困难提出合理的还款方案：如分期偿还本金、减少利息或罚息等
4. 4.成功案例：在一些案例中，借款人通过与贷款机构积极沟通，最终达成了一致的还款方案。例如，借款人A因生意亏损导致网贷逾期三年未还，最终通过与网贷平台协商，分期偿还本金并减免部分逾期利息
5. 5.注意事项：在协商过程中，借款人应保持诚实守信的态度，提供真实可靠的资料，并充分了解每期还款的时间、金额及违约责任等内容

网贷逾期三年后，借款人通常不能只还本金，但可以通过与贷款机构积极协商，寻求更为灵活的还款方案。