查博士S级车存在以下缺点：

1. 检测项目少 ：查博士的二手车检测项目非常有限，主要集中在事故车、泡水车、火烧车等项目上。对于大事故车更换零件等项目，查博士并不会进行检测。这导致购买查博士S级车的消费者可能面临较大的安全风险，因为即使车辆更换了零件，也可能存在安全隐患。

2. 发动机不保障 ：查博士的S级车不提供发动机保障，这意味着消费者在购买后如果发动机出现问题，将无法获得相应的维修或更换服务。

3. 出险和维保记录缺失 ：查博士的S级车没有出险和维保记录，这对于需要了解车辆历史维修情况的消费者来说是一个重要缺失。缺乏这些记录可能使消费者在购买后难以准确评估车辆的真实车况和潜在风险。

4. 培训上岗问题 ：查博士的检测人员是培训上岗的，虽然基础的检测项目没有问题，但在一些需要丰富经验来判断的检测项目上可能不够精确。

5. 安全性减配严重 ：查博士的S级车在安全性方面存在减配问题，例如中外版本的区别对待、双离合变速箱低速顿挫明显、国六车型有颗粒捕捉器堵塞问题、底盘偏硬导致舒适性一般、不同车型的调教差异大等。

6. 中外区别对待 ：查博士在不同版本的车上存在中外区别对待的情况，这可能影响到消费者对车辆性能和配置的期望。

7. 双离合变速箱问题 ：查博士的S级车配备的双离合变速箱在低速行驶时存在明显的顿挫感，这会影响驾驶体验。

8. 国六车型颗粒捕捉器堵塞 ：部分国六车型的查博士S级车存在颗粒捕捉器堵塞问题，这可能导致车辆性能下降，甚至影响排放。

9. 底盘偏硬 ：查博士的S级车底盘偏硬，导致乘坐舒适性一般，可能不适合对舒适性有较高要求的消费者。

10. 调教差异大 ：不同车型的查博士S级车调教差异较大，这可能影响消费者的驾驶感受和车辆表现。

查博士S级车在检测项目、发动机保障、历史维修记录、检测人员的专业性、安全性配置、中外版本差异、变速箱性能、排放问题、底盘舒适性和调教方面存在明显的缺点。消费者在购买时应充分考虑这些因素，以确保购车安全和满意度。