大病二次报销是否可以在医院直接办理，这取决于多个因素，包括当地的医保政策、医院的联网情况以及具体的实施细节。一般来说，在许多地区，如果医院实现了全国或地方的医保系统联网，并且患者符合二次报销的条件，那么在出院时可以通过医院的大病结算窗口直接进行二次报销。

当患者在当地二甲医院或定点医院就医时，使用医保卡或新农合医疗证办理住院登记。出院时，携带相关资料（如费用清单、出院小结等）前往医院大病结算窗口，医院根据医保政策直接垫付大病保险赔付资金，患者只需支付剩余部分费用。

对于异地就医或者医院未实现联网的情况，患者可能需要先行垫付医疗费用，然后携带必要的材料（如医保卡、身份证、医疗费用原始凭证、费用清单、就诊证明等）到当地医保机构申请二次报销。

值得注意的是，尽管很多地方正在推行一站式服务以简化流程，但各地的具体操作和要求可能会有所不同。例如，在某些地区，新农合的大病二次报销并不是出院时直接结算的，而是需要患者先自行垫付一部分费用，再向社保局或新农合经办机构申请。

因此，为了确保信息准确无误，建议患者或家属提前咨询所在地区的医保部门或通过“国家医保服务平台APP”查询相关信息。了解清楚所需的全部文件和步骤也是非常重要的，因为不同的地方可能对所需材料有不同的规定，比如有的地方可能需要提供诊断书、病历本等额外的证明材料。

虽然理论上很多情况下可以在医院直接完成大病二次报销，但由于各地政策执行上的差异，最好还是事先确认好本地的具体操作流程和要求。这样可以避免不必要的麻烦，确保及时获得应有的报销待遇。如果遇到任何疑问或困难，也可以寻求专业的法律咨询或是联系当地的医保办公室获取帮助。