康复治疗师能当主任，但需具备一定条件并面临诸多挑战。以下是具体分析：

一、优势方面

1. 专业能力：康复治疗师在长期的专业学习与实践中，积累了丰富的康复专业知识和技能，能够更好地指导团队开展各类康复治疗工作，确保治疗的科学性和有效性。

2. 行业了解：他们深入了解康复行业的现状和发展趋势，熟悉不同康复领域的特点和需求，有助于制定符合实际的科室发展规划，推动康复业务的拓展和创新。

3. 沟通协调：在与患者及其家属沟通方面，康复治疗师具有天然的优势，能够更好地理解患者的需求和心理状态，建立良好的医患关系，提高患者的治疗依从性和满意度。同时，他们也善于与医疗团队中的其他专业人员进行协作沟通，促进多学科团队的高效运作。

4. 管理能力潜力：部分康复治疗师在工作中会逐渐培养出一定的组织协调和管理能力，如负责治疗项目的策划与实施、团队人员的培训与考核等，为担任管理职务奠定基础。

二、面临的挑战

1. 学历背景限制：在一些大型医疗机构或高校附属医院，对科主任的学历要求较高，通常需要硕士及以上学位，而康复治疗师大多为本科及以下学历，这在一定程度上限制了他们晋升为主任的机会。

2. 竞争压力较大：医院中往往有众多优秀的医生和管理人员竞争科主任职位，康复治疗师需要在专业技能、科研能力、教学水平以及管理经验等方面不断提升自己，才能在竞争中脱颖而出。

3. 领导能力培养：尽管康复治疗师具备一定的管理能力潜力，但要从专业的技术人员转变为全面的管理者，还需要系统地学习和培养领导能力，包括决策能力、团队建设、资源分配、战略规划等方面的知识和技能。

总的来说，康复治疗师凭借其专业能力、行业了解、沟通协调及管理能力潜力等优势，完全有机会担任主任职务。他们也面临着学历背景限制、竞争压力较大及领导能力培养等挑战。因此，康复治疗师若想成为主任，需不断提升自我，克服挑战，以适应这一角色的高要求。