烟台山医院拥有多个重点科室，这些科室在各自的领域中都有着较高的医疗水平和专业实力。以下是一些被广泛认为较为优秀的科室：
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神经内科：是山东省级临床重点专科，在帕金森病、脑卒中、头晕、焦虑抑郁等疾病诊治方面具有丰富经验，尤其在帕金森病、肌张力障碍、震颤等症状的鉴别诊断及治疗上技术先进，还开展了脑起搏器（DBS）治疗帕金森病及肉毒素注射治疗流涎、痉挛性斜颈、面肌痉挛等项目。
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心血管内科：作为烟台市级医疗卫生重点学科，对冠心病、高血压、高脂血症、心律失常、心肌病等疾病的诊断和治疗有着丰富的经验和较好的疗效。
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消化内科：也是烟台市级医疗卫生重点学科，从2015年起参加“国家重大公共卫生服务项目上消化道早诊早治项目”筛查工作，并连续获得相关荣誉。该科室拥有专业的医疗团队和先进的内镜设备，常规开展多种内镜下诊治技术，如内镜下粘膜切除术、内镜下粘膜剥离术等，对消化道早癌、肝病、胰腺疾病、炎症性肠病、缺血性肠病及消化道大出血等疾病具有良好的综合诊治水平。
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康复医学科：是山东省级重点专科，能够为患者提供全面的康复评估和个性化的康复治疗方案，帮助患者恢复身体功能，提高生活质量。
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电生理科：成立于1971年，经过多年发展已成为集医疗、科研、教学、健康查体等多功能为一体的综合性科室，在心电图、24小时动态心电图、小儿心电图的诊断，尤其是心肌梗塞、心律失常等疑难心电图的诊断方面具有优势。
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胸外科：是烟台市级临床重点学科，在胸部疾病的手术治疗方面有着较高的技术水平和丰富的临床经验。
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介入医学科：同样是烟台市级临床重点学科，擅长通过介入技术诊断和治疗各种疾病，具有创伤小、恢复快等优点。
总的来说，烟台山医院的科室设置齐全，各科室之间协作紧密，能够为患者提供全方位的医疗服务。无论是常见疾病还是疑难杂症，都能在这里得到及时、有效的诊治。
