深圳社保断交三个月，补缴方式如下：
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单位原因导致的断缴：
- 如果是因为用人单位未按时足额缴纳社会保险费导致参保人中断缴费的，用人单位可以向有关部门提交申请要求进行补缴。用人单位需要提供相关证明材料，如财务报表、工资单等，以证明是由于单位原因导致的欠费。
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个人原因导致的断缴：
- 通过单位补缴：如果是因工作调动等原因导致社保断缴不超过三个月，且新老单位都在深圳，可以由新单位出具证明材料并协助办理补缴手续。但通常这种补缴方式也较为复杂，需要单位配合。
- 找社保代缴机构补缴：可以选择第三方社保代缴机构来代为补缴。不过需要注意的是，选择社保代缴机构时要谨慎，确保其合法可靠且值得信赖，以免上当受骗。通过这种方式补缴需要自己承担全部费用以及支付给代缴机构的服务费。
- 个人身份补缴（限深户）：只有深圳户籍的个人才可以自行前往深圳社保局或通过线上渠道（如深圳市社会保险基金管理局官网、“深圳社保”微信公众号、“i深圳”APP等）申请补缴断交的社保。非深户个人一般不能直接补缴。
深圳社保断交三个月后，根据不同情况可选择不同补缴方式。单位原因需单位申请并提供证明材料；个人原因则可通过新单位协助（限特定情况）、找合法代缴机构或个人身份（限深户）补缴，但要注意相关风险与费用。