草甘膦对土壤和下茬作物有一定影响，具体如下：
对土壤的影响
- 改变土壤养分有效性：草甘膦会与土壤中的铁、铝、锌、铜、锰等金属离子结合。如草甘膦的降解产物磷酸根易与土壤中的铁、锌结合，降低铁、锌的有效性，可能使植物出现缺铁、锌等症状。
- 影响土壤微生物群落：草甘膦的使用可能会改变土壤微生物的种类和数量。一方面，它可能抑制一些对植物生长有益的微生物，如菌根真菌等，影响植物与微生物的共生关系，降低植物对养分的吸收能力和抗逆性。另一方面，可能会导致一些有害微生物如镰刀菌等的增殖，增加植物患病的风险。
- 导致土壤板结：长期大量使用草甘膦，可能会破坏土壤结构，使土壤通气性和透水性变差，从而导致土壤板结，影响植物根系的生长和发育。
对下茬作物的影响
- 存在药害风险：如果草甘膦使用不当，如用量过大、浓度过高、喷施后间隔时间过短就种植下茬作物，可能会对下茬作物产生药害。表现为种子发芽率降低、幼苗生长缓慢、叶片发黄、畸形，甚至植株死亡。尤其是一些对草甘膦较为敏感的作物，如蔬菜、花卉等。不过正常使用情况下，草甘膦入土后很快与金属离子结合而失去活性，一般不会影响下茬作物。
- 影响生长发育和产量：即使没有明显的药害症状，草甘膦对下茬作物的生长发育和产量也可能有潜在影响。例如，可能影响作物根系的生长和发育，降低根系对水分和养分的吸收能力，进而导致植株生长瘦弱，产量降低。草甘膦对土壤养分有效性和微生物群落的影响，也会间接影响下茬作物的生长和发育。
不过，草甘膦在土壤中的行为特性显著，主要表现为强烈的吸附性，导致其在土壤中不易移动，且可被微生物迅速降解为氨甲基膦酸，在土壤中的半衰期约为 47 天。为减少草甘膦对土壤和下茬作物的影响，使用时应严格按照说明书的要求进行操作，控制用药量和用药时间，避免在临近种植下茬作物时使用，同时可采取轮作、增施有机肥等措施来改善土壤结构和肥力，减轻草甘膦的残留影响。
