全国试管婴儿医院排名最好的医院如下：

1. 北京大学第三医院：作为国内首家开展试管婴儿技术的医院，北京大学第三医院在该领域表现突出。根据公开数据显示，该院试管婴儿的成功率约为60%。

2. 山东大学附属生殖医院：为山东省唯一一家具有胚胎植入前遗传学诊断(PGD)资质的单位，能做三代试管。

3. 郑州大学第一附属医院：生殖医学中心1998年面世河南省第一例基本上试管婴儿，2000年被河南省卫生厅准许为“河南省生殖医学中心”。 2006年被中国卫生部准许为国内各地十家大家辅助生殖技术学习培训中心之一。 2011年在我国第一例应用单细胞SNP集成化芯片技术进行试管婴儿胚胎置入前分子遗传学诊断临床医学专业孕期获得成功，并孕妇生产一身体健康女宝，填补中国缺口。

4. 中信湘雅生殖与遗传专科医院：中信湘雅生殖与遗传专科医院是经湖南省卫生和计划生育委员会批准的三级生殖与遗传专科医院。 院长卢光琇是我国辅助生殖领域泰山北斗式的人物，至今仍然活跃在试管婴儿技术的最前沿。 医院一年辅助生殖治疗周期相当于美国总量1/4。 2019年，医院实施辅助生殖周期超5.2万个，平均临床妊娠率达62.6%。 截至目前，经医院试管出生婴儿累计超16万个，为家庭和社会做出积极贡献。

5. 南京市鼓楼医院：南京市鼓楼医院（南京大学医学院附属鼓楼医院），是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性大型三级甲等医院。随着医院综合实力的不断提升，越来越多的患者慕名前来就诊。在2020年发布的中国医院科技量排行榜中，医院综合排名位列全国第26名，在2019年度医院学科科技量值（STEM）排名中，普通外科学、骨外科学、心血管病学、泌尿外科学、重症医学、麻醉学、肿瘤学、神经病学、内分泌病学与代谢病学、皮肤病学、耳鼻咽喉科学、急诊医学、重症医学等13个学科进入全国前20。

这些医院在试管婴儿技术方面都有着较高的实力和丰富的经验，能够为不孕不育患者提供高质量的医疗服务。