百草枯的危害相对更大，以下从多个方面进行分析：
- 毒性
- 草甘膦：一般被认为是低毒除草剂。但大剂量摄入时，可能会引起呼吸衰竭、休克等导致死亡。其浓缩溶液可能引起皮肤刺激，对眼睛有严重损害风险。有研究显示它可能是潜在的内分泌干扰物，对人类健康存在一定潜在风险。
- 百草枯：毒性极大，口服致死量为 1 - 3g（即 20% 原液 5ml），病死率通常在 50% - 70% 甚至更高。
- 对人体的危害
- 草甘膦：中毒案例主要源于摄入、吸入和皮肤接触。口服后 15 分钟内可能出现呕吐和喉咙疼痛等症状，随后可能发生腹痛和腹泻。严重中毒患者可能出现低血压、口腔溃疡、消化道溃疡、呼吸困难、咳嗽、发绀、少尿和肾功能损伤、电解质失衡等症状，死亡原因多为呼吸系统损伤。
- 百草枯：可经消化道、呼吸道、皮肤等吸收。经口摄入后，会在肺组织主动蓄积，导致多脏器功能不全，呼吸衰竭是患者死亡的主要原因。经口中毒者有口腔烧灼感，口腔、食管黏膜糜烂溃疡、恶心、呕吐、腹痛、腹泻，甚至呕血、便血等症状。部分病人出现肝脏肿大、黄疸和肝功能异常，甚至肝功能衰竭。还可能有头晕、头痛，少数患者发生幻觉、恐惧、抽搐、昏迷等中枢神经系统症状。
- 对环境的危害
- 草甘膦：在土壤中能被微生物迅速降解为氨甲基膦酸，半衰期约为 47 天，不易移动，对水源污染风险较低。在水生环境中，倾向于吸附在悬浮固体和沉积物上，不易生物富集，对水生生态系统的潜在风险相对较小。
- 百草枯：在环境中较为稳定，不易降解，容易造成环境污染。对水生生物毒性高，且可能通过食物链传递和积累，对生态系统的平衡产生较大影响。
由于百草枯对人类健康和环境的危害极大，我国已于 2014 年撤销其登记，2016 年停止水剂在国内使用。而草甘膦目前仍在广泛使用，但在使用过程中也需要严格按照操作规程，做好防护措施，以减少对人体和环境的危害。
