根据2025年最新信息，江苏省南京市在治疗语言障碍方面具有专业资质的医院主要包括以下机构：

一、综合医院及专科医院

1. 南京天佑儿童医院

   • 专注儿童语言发育障碍、自闭症、多动症等发育问题的综合诊疗，拥有国务院特殊津贴专家团队，采用“三维一体1:1:1脑神经康复核心技术”，是江苏省儿童专科医院及医保定点医院。

2. 南京医科大学附属江宁医院

   • 言语障碍科可提供专业评估与治疗，地址位于江宁区鼓山路168号。

二、康复机构推荐

1. 东方启音儿童康复中心

   • 国内知名儿童语言康复机构，擅长早期筛查、临床训练与干预，成立时间较早，服务范围广。

2. 子曰儿童发展中心

   • 提供个性化语言发育评估及矫正方案，注重自然疗法与家庭互动。

3. 大米和小米康复机构

   • 专注儿童语言/语音/发音矫正，采用游戏化训练提升学习兴趣。

三、其他相关机构

• 南京天佑医院 （综合医院）：儿科设有语言发育障碍诊疗科室，可进行多学科联合干预。

• 南京雨花台区康复机构 ：如星语星愿语言发育中心，提供专业评估与训练服务。

四、选择建议

• 综合医院 适合需要多学科联合诊疗的复杂病例；

• 专科医院 在技术深度和针对性治疗上更具优势；

• 康复机构 则侧重长期训练与家庭支持。

建议根据患儿具体情况，结合医院专业领域、服务模式及医保覆盖范围进行选择，并通过正规渠道预约挂号。