根据搜索结果，2025年江苏南京在治疗月经不调方面具有专业实力的医院主要包括以下机构：

一、综合实力型医院

1. 江苏省妇幼保健院

   妇科是首批卫生部国家临床重点专科，涵盖妇科肿瘤、内分泌治疗、微创手术等全领域，拥有国内知名专家团队。

2. 南京医科大学第一附属医院

   妇科在妇科肿瘤规范化诊治、腹腔镜手术等方面居国内领先，擅长宫颈癌根治术、子宫内膜癌分期手术等高难度操作。

3. 南京鼓楼医院

   产科与妇科均是国家临床重点专科，妇科内镜手术技术领先，提供全面的妇科及产科医疗服务。

二、专科医院与高口碑机构

1. 南京生殖医院

   专注于生殖健康领域，对月经不调相关的生育问题有深入研究。

2. 南京家和医院

   多个分院（如妇科医院、妇产医院）在妇科疾病诊疗中具有较高口碑，尤其擅长全面检查与精准病因诊断。

3. 南京微创医院

   以微创技术为特色，结合内分泌治疗提升月经不调患者的治疗效果。

三、其他推荐机构

• 南京世纪现代妇产医院 ：位于江宁区，提供妇科疾病诊疗服务。

• 南京溧水区妇幼保健院 ：在溧水区设有分院，可预约挂号。

四、选择建议

• 疾病紧急情况 ：优先考虑江苏省妇幼保健院、南京医科大学第一附属医院等综合实力强的医院。

• 区域服务 ：江宁区患者可关注南京世纪现代妇产医院，溧水区患者可联系溧水区妇幼保健院。

• 口碑参考 ：南京家和医院因患者评价较高，适合注重服务体验的患者。

建议通过医院官网或预约平台（如名医汇）进一步确认科室排期及专家信息。