医保中公司缴纳部分的作用主要包括以下几点：

1. 建立统筹基金 ：公司缴纳的基本医疗保险费一部分用于建立统筹基金。统筹基金用于支付住院和部分慢性病门诊治疗的费用，设有起付标准和最高支付限额。

2. 支付部分医疗费用 ：统筹基金可以支付参保人员在定点医疗机构门诊和住院发生的由个人承担的医疗费用（非疾病治疗类除外）、预防性免疫疫苗费用、健康体检费用，以及在定点零售药店购买药品、医疗器械和消毒用品的费用。

3. 减轻个人负担 ：通过统筹基金的使用，参保职工在生病或受伤时可以获得部分或全部的报销，从而减轻医疗费用的负担。

4. 保障基本医疗服务 ：医保制度旨在保障职工享有基本的医疗服务，通过社会统筹与个人账户相结合的方式，既发挥社会统筹共济性的长处，也发挥个人账户的激励和制约作用。

5. 促进医疗资源合理使用 ：通过对医疗服务的管理和对医疗机构、药店的资格认定，医保制度有助于促进医疗资源的合理使用，实现“用比较低廉的费用提供比较优质的医疗服务”的目标。

6. 实现社会共济 ：医保的统筹部分体现了社会共济的原则，通过集中资金池来应对大规模的医疗需求，增强医保制度的可持续性。

综上所述，公司缴纳的部分主要用于建立统筹基金和支付部分医疗费用，从而帮助参保职工减轻个人医疗负担，保障其基本医疗需求，并通过社会共济机制促进医疗资源的合理使用。