根据搜索结果，2025年吉林市治疗咳嗽（包括疫咳、百日咳等呼吸道感染）的医院推荐如下：

一、综合实力较强的三级甲等医院

1. 吉林市中心医院

   • 传染科是吉林地区规模最大、综合实力最强的三级甲等医院，拥有丰富的传染病诊疗经验，设备完善且人员专业。

   • 地址：吉林市船营区南京街4号

2. 吉林医药学院附属医院

   • 原为解放军第四六五医院，1996年评为三级甲等，2004年转隶吉林医药学院管理。传染科诊疗设施先进，口碑良好。

二、其他三级医院及专科医院

• 吉林市人民医院

  三级甲等综合医院，呼吸内科在呼吸道感染治疗方面有较高水平。

• 吉林市中西医结合医院

  三级甲等专科医院，擅长中西医结合治疗呼吸道疾病。

• 北华大学附属医院

  三级甲等大型医院，呼吸与危重症医学科实力突出。

三、其他推荐医院

• 吉林大学第二医院 （长春市）

  三级甲等，呼吸病学专业排名全省第一，适合复杂病例会诊。

• 吉林大学中日联谊医院

  三级甲等，中日合作特色医院，呼吸疾病诊疗技术先进。

四、选择建议

• 疫咳/百日咳 ：优先选择吉林市中心医院或吉林医药学院附属医院。

• 反复呼吸道感染 ：可考虑吉林大学第二医院等专科医院。

• 综合治疗 ：三级甲等综合医院（如吉林市中心医院）提供更全面的医疗服务。

建议根据具体病情选择医院，并提前电话咨询预约（如吉林市中心医院0432-62456181）。