南宁的医院众多，以下是一些综合实力或专科实力较强的医院：
综合医院
- 广西医科大学第一附属医院：广西首家三级甲等综合医院，综合实力连续 9 年位列复旦版华南前三。拥有国家临床重点专科 14 个，广西临床重点专科（含建设项目）22 个，广西各类重点学科 28 个。优势专科有地中海贫血、肝癌、鼻咽癌、心血管疾病等。
医院 广西医科大学第一附属医院
- 广西壮族自治区人民医院：自治区人民政府主办的广西规模最大的三级甲等公立医院，2021 年 5 月获批挂牌广西医学科学院。拥有自治区重点专科 30 个、国家级培训基地 18 个，心血管内科、神经内科、骨科等为其优势专科。
- 广西中医药大学第一附属医院：集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的现代化综合性三级甲等中医医院，建设有脑病科、肝病科、心血管病科、儿科、脾胃病科 5 个国家临床重点专科，在中医诊疗方面特色鲜明。
- 南宁市第一人民医院：拥有百年历史的国家三级甲等综合性医院，有肾内科、重症医学科、神经内科、临床护理、骨科、血液内科等 9 个广西壮族自治区临床重点专科。
- 南宁市第二人民医院：集医疗、急救、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等综合性医院，拥有儿科、神经外科、麻醉科、产科、内分泌科、妇科等 9 个自治区重点专科。
专科医院
- 广西医科大学附属肿瘤医院：广西唯一一家集医疗、科研、教学、预防保健、社区服务与康复为一体的省级肿瘤防治研究机构，肿瘤学专科连续六年位列复旦版华南区医院专科声誉排行榜第二名。
- 广西医科大学附属口腔医院：国家三级甲等口腔专科医院，是广西口腔医学教学、科研、医疗、保健中心。
- 广西壮族自治区妇幼保健院：集保健、医疗、科研、教学和基层妇幼保健指导为一体的三级甲等妇幼保健院，在遗传疾病诊断、辅助生殖、危重孕产妇抢救和新生儿危重症救治等方面技术领先。
