新农合合作医疗报销比例根据就诊级别、医疗机构类型及费用类型有所不同，具体如下：

一、门诊报销比例

1. 村卫生室/乡卫生院

• 报销比例：60%

• 年度封顶线：个人缴费额的60%

• 处方药费限额：10元/次

2. 镇卫生院

• 报销比例：40%

• 检查/手术费限额：50元/次

• 处方药费限额：100元/次

3. 二级医院

• 报销比例：30%

• 检查/手术费限额：50元/次

• 处方药费限额：200元/次

4. 三级医院

• 报销比例：20%

• 检查/手术费限额：50元/次

• 处方药费限额：200元/次

二、住院报销比例

1. 起付线标准

• 一般设为1000元，超过部分按比例报销

• 60岁以上老人每天补偿10元，限额200元

2. 报销比例

• 镇卫生院 ：60%

• 二级医院 ：40%

• 三级医院 ：30%

三、大病报销比例

1. 分段补偿标准

• 5001-10000元 ：65%

• 10001-18000元 ：70%

• 18001-30000元 ：75%

• 30001-40000元 ：80%

• 40001元以上 ：85%

2. 特殊病种

• 儿童先心病等8种大病、肺癌等12种大病，补助比例达70%

四、其他注意事项

1. 地区差异

• 经济发达地区报销比例较高（如80%），欠发达地区较低（如60%）

• 具体比例需以当地政策为准

2. 报销流程

• 需通过当地合作医疗管理机构或医疗机构医保结账窗口办理

以上信息综合了2025年最新政策及多地执行标准，实际报销比例可能因地区政策调整而变化。