灵活就业人员养老和医保的主要区别体现在以下几个方面：
- 参保险种 ：
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灵活就业人员参加的是企业职工基本养老保险和医疗保险两险。
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企业职工参保则包括基本养老保险、医疗保险（含生育保险）、工伤保险以及失业保险四险。
- 个人缴费比例 ：
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灵活就业参保费用全部由个人承担，养老保险缴费比例为20%（其中12%计入基本养老保险统筹基金，8%计入个人账户），医疗保险缴费比例为10%。
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企业职工参保费用则由用人单位和职工共同缴纳，养老保险个人缴费比例为8%，医疗保险为2%，失业保险为0.5%。
- 参保缴费主体 ：
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灵活就业参保由个人自行办理社会保险登记并缴费。
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企业职工参保由用人单位为职工办理社会保险登记，职工个人应缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴。
- 缴费基数 ：
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灵活就业人员可以根据自身经济状况选择按年或按月连续缴费，缴费基数一般为各地上年度在岗职工年平均工资的60%左右。
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企业职工的缴费基数则根据职工本人的工资水平确定，通常在当地上年度全口径城镇单位就业人员月平均工资的60%至300%之间。
- 医保待遇 ：
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灵活就业人员参加职工基本医疗保险后，可以享受与城镇职工相同的医保待遇，包括住院、门诊等医疗费用的报销。
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一些地区为灵活就业人员设置了不同的缴费档次，对应不同的医保待遇，例如，有的地区分为一档和二档，一档缴费较高，但医保待遇也更好，包括更高的报销比例和更高的年度限额等。
- 缴费年限合并计算 ：
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灵活就业人员的养老保险和医疗保险缴费年限可以与企业职工的养老保险和医疗保险缴费年限合并计算。
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合并计算需满足在不同阶段的社保缴纳记录中没有重复缴费的时段。
总结：
灵活就业人员的养老保险和医疗保险在参保险种、个人缴费比例、参保缴费主体、缴费基数、医保待遇以及缴费年限合并计算等方面与企业职工存在明显差异。灵活就业人员需要自行办理社会保险登记并承担全部缴费费用，但可以享受与城镇职工相同的医保待遇。建议灵活就业人员在选择参保时，充分了解当地政策，选择最适合自己的缴费档次和方式，以确保自身的社保权益。
