昌吉市慢病申请流程如下：

一、申请条件

1. 参保要求 ：需参加职工医保或灵活就业医保；

2. 疾病范围 ：需符合国家或地方规定的慢性病目录；

3. 其他要求 ：年龄、性别等条件需符合当地政策规定。

二、所需材料

1. 基础材料

• 身份证原件及复印件；

• 社保卡（一卡通）原件及复印件；

• 近三年内住院病历（含出院小结、诊断证明）。

2. 补充材料

• 退休人员需提供社区劳动保障站盖章的申请表；

• 部分病种需辅助检查资料、疾病证明书、诚信计生证明等。

三、申请流程

1. 线上申请

• 通过当地医保网上办事大厅“慢病申请”专栏提交材料；

• 需上传身份证、社保卡照片、病历资料等。

2. 线下申请

• 单位申报 ：职工由单位医保部门提交材料至市医保中心窗口；

• 社区申报 ：退休及灵活就业人员到社区劳动保障站办理；

• 定点医院申报 ：部分病种可持材料至指定医院医保科申报。

四、审核与待遇

1. 材料审核

• 医疗机构对病历、诊断证明等材料进行初审，符合条件的签发《慢性病诊断证明》；

• 市医保中心复核通过后，发放《特殊病种门诊专用病历》。

2. 待遇享受

• 定额内费用按70%报销，具体额度根据病种和医保政策确定；

• 需定期复诊并提交病情报告，病情变化可申请调整治疗方案。

五、注意事项

1. 时间要求 ：材料需在季度末前提交，审核一般需15个工作日；

2. 变更管理 ：若需延长报销期限，需向医保局申请；

3. 政策咨询 ：具体材料清单及流程可咨询单位医保部门或市医保中心。

以上流程综合了线上、线下及定点医疗机构三种申请方式，建议根据自身情况选择最适合的途径。