新疆昌吉的国企包括：

1. 新疆蓝山屯河科技股份有限公司 ：该公司是自治区一类国有企业新疆投资发展（集团）有限责任公司（简称新投集团）的二级控股企业，总部位于昌吉州昌吉市乌伊东路132号。

2. 新疆新投能源装备股份有限公司 ：该公司也是新投集团的二级控股企业，落户于新疆昌吉国家级高新技术产业开发区，占地400亩。

3. 昌吉州国有资产投资经营集团有限公司 ：该公司提供对农业、煤炭、金属及其他非金属矿、石油、天然气、旅游、文化行业的投资；对养老、健康产业的投资和建设；以及公路、机场建设和轨道交通建设、管理、运营等。

4. 新疆允能电力工程有限公司 。

5. 新疆伊麦尔香食品有限公司 。

6. 新疆康利来生物科技开发有限公司 。

7. 新疆准东经济技术开发区准欣企业管理咨询有限责任公司 。

8. 昌吉州交通建设有限责任公司 ：该公司是昌吉州国有资产投资经营集团有限公司的全资子公司，主要负责自治州重点交通（公路）项目建设、实施、管理、养护、收费经营和沿线配套开发等。

9. 昌吉市国有资产投资控股集团有限公司 ：该公司是昌吉国有资产旗下企业，属于以从事租赁和商务服务业为主的企业。

这些企业在昌吉地区的经济中扮演着重要角色，涵盖了能源、交通、建设、旅游等多个领域。