灵活就业医保不能报销的原因可能有以下几点：

1. 欠费情况 ：如果灵活就业人员没有按时足额缴纳医保费用，或者当月缴纳了上月费用（即欠费），则会影响报销。例如，如果2月交1月费用，3月交2月费用，这种情况就属于欠费，当月住院就不能报销。

2. 断缴情况 ：灵活就业人员医保断交1个月，当月就会暂停支付医保待遇。中断次月补齐断缴月份并足额缴纳当月费用，并且不再产生新欠费，中断当月和次月的医疗费用正常报销。

3. 没有个人账户 ：灵活就业人员购买的医保卡通常没有个人账户，只有职工医保有个人账户，并且会每个月返钱到医保卡账户上。灵活就业人员不能享受门诊买药报销的待遇，只能住院报销。

4. 缴费档次 ：灵活就业人员参加的是城镇职工医疗保险，如果选择的是低标准缴费，则不会建立个人医保账户。这种情况下，门诊看病或者去药店买药的时候，就没法享受报销待遇。

5. 定点机构 ：如果灵活就业人员在看门诊时没有在定点的基层医疗卫生机构看诊，或者产生的门诊费用超出普通门诊统筹最高支付限额，这种情况下也不会报销。

6. 起付线 ：看病时，需要超过起付线才能报销。起付线分为住院起付线和门诊起付线，只有超过了起付线才能报销。不同医院的起付线和报销比例也不一样。

7. 非定点机构 ：不是所有医院都可以报销，需要是医保定点的医疗机构才能享受报销待遇。

综上所述，灵活就业医保不能报销的原因可能包括欠费、断缴、没有个人账户、缴费档次低、未在定点机构看诊、超出支付限额以及未达到起付线等原因。建议灵活就业人员按时足额缴纳医保费用，并选择合适的缴费档次，确保在定点机构看诊，以享受医保报销待遇。