南京未能成为一线城市的原因是多方面的，主要包括以下几点：

1. 地理位置因素 ：南京位于江苏西南部，虽然毗邻上海，但距离上海较远，约300公里，这使得南京难以直接受到上海的经济辐射和带动。同时，南京周边的城市如苏州、无锡等也受到上海的强烈影响，进一步分散了南京的发展资源。

2. 苏南模式的影响 ：江苏在90年代全力投入“苏南模式”的建设中，苏州、常州、无锡等城市因此得到了迅猛发展，形成了均衡发展的格局。这种均衡模式在一定程度上抑制了南京等单一城市的崛起。

3. 人口规模和人才问题 ：南京的常住人口仅为942万人，远低于杭州、成都、武汉等城市，甚至不及北上广深等一线城市的一半。人口规模是衡量城市综合能力的重要指标，南京在人口方面不具备成为一线城市的优势。

4. 产业竞争力不足 ：南京虽然拥有一定的产业基础，但缺乏具有全球性影响力的产业。一线城市的产业通常具有高度的创新性和全球性影响力，能够吸引全球范围内的资源和人才。江苏目前的产业虽然发达，但尚未形成具有全球性影响力的产业集群，这使得南京在产业竞争力上难以与一线城市相抗衡。

5. 政策环境制约 ：南京在国家城市规划的顶层设计中尚未尝到大甜头，政策环境对其发展产生了一定的制约。例如，江苏作为全国唯一一个所有城市都是二级财政的省份，财政资源分散，难以集中力量支持南京等城市的建设和发展。

6. 国企过多，民营经济发展不足 ：南京被称为“养老城市”，国企较多，民营经济发展不足，缺乏吸引年轻人的原力。这种情况使得南京在经济发展和创新能力上受到了一定的限制。

综上所述，南京未能成为一线城市的原因主要包括地理位置、苏南模式的影响、人口规模和人才问题、产业竞争力不足、政策环境制约以及国企过多、民营经济发展不足等多方面因素。尽管南京在新一线城市榜单中多次上榜，但距离真正的一线城市还有一定的差距。