西藏昌都地区治疗新生儿泪囊炎的医院推荐如下：

1. 西藏自治区人民医院

   作为地区内综合实力较强的医院，医疗设施齐全，具备丰富的新生儿泪囊炎诊疗经验。

2. 中国人民解放军西藏军区总医院

   前身为川东军区直属医院，1955年进藏后更名为西藏军区总医院，医疗技术水平较高，可提供专业泪囊炎治疗。

3. 那曲地区人民医院

   位于那曲地区，联系电话为0896-3822389，属于地区性综合医院，可处理泪囊炎相关病症。

建议 ：优先选择西藏自治区人民医院或中国人民解放军西藏军区总医院，若需本地化服务可考虑那曲地区人民医院。建议提前电话咨询医院科室设置及诊疗方案。