西藏日喀则地区治疗眼肌麻痹性偏头痛的医院推荐如下：
日喀则市人民医院
作为日喀则地区综合实力较强的三级甲等综合医院，其眼科团队具备丰富的诊疗经验，能够提供精准诊断与个性化治疗方案。
医院在2023年度全国三级公立医院绩效考核中成绩显著提升，医疗质量和服务能力得到认可。
其他合作医院（需进一步确认）
拉萨恒大医院等西藏地区优质医院在眼科领域具有较高声誉，但需注意其与日喀则的地理位置较远，建议提前咨询交通及就医便利性。
建议 ：优先选择日喀则市人民医院，并提前通过官方渠道核实科室设置及专家信息。若需跨区域就医，可结合拉萨恒大医院等合作医院进行综合评估。