新农合（新型农村合作医疗）与居民医保（城乡居民基本医疗保险）之间的主要区别体现在以下几个方面：
- 参保人群不同 ：
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新农合主要针对具有农村户籍的居民，通常以家庭为单位整户参保。
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居民医保则覆盖更广泛的范围，包括城镇和农村户口的居民，以及在校学生、在内地居住且办理港澳台居民居住证的未就业港澳台居民、在内地就读的港澳台大学生等。
- 缴费情况不同 ：
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新农合由参保农民按年度缴纳，政府也会提供一定的财政补贴。
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居民医保同样由居民按年缴费，个人缴费的同时享受政府的财政补贴。
- 保障待遇不同 ：
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新农合的报销比例相对较低，通常在10%-80%之间，且药品目录较少，市级及以上医院的报销比例低于居民医保。
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居民医保的报销比例通常为70%左右，药品范围更广，能够为参保居民提供更为充分的医疗保障。
- 管理部门不同 ：
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新农合在多数地方由卫生部门管理。
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居民医保主要由人力资源和社会保障部门负责管理和运作。
- 保障内容与侧重点不同 ：
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新农合主要侧重于保障农民在乡镇卫生院的医疗需求，门诊待遇水平相对较高。
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居民医保则主要保障住院和门诊大病，兼顾普通门诊，因此其住院及门诊大病待遇要高于新农合。
- 整合情况 ：
- 新农合目前已经整合到了居民医保内，两者在整合后实行一样的参保政策、报销待遇和报销流程。
综上所述，新农合和居民医保在参保人群、缴费情况、保障待遇、管理部门、保障内容与侧重点等方面均存在显著差异。建议根据个人户籍和实际情况选择合适的医保类型，并在条件允许的情况下购买商业保险以获得更全面的医疗保障。