专门的眼科医院和三甲医院各有其优势，选择哪个更好取决于患者的具体需求和眼部疾病的复杂程度。以下是对两者的分析：
专门的眼科医院
专业程度高：专门的眼科医院集中了所有的人力、财力和资源，对眼科疾病进行专门的研究和治疗，技术力量更为突出。例如，爱尔眼科医院集团及旗下全球员工总数达50000余人，其中眼科医生及视光师总数（含海外）9000余人，包括一大批博士生导师、硕士生导师、博士、博士后、留学欧美的学者以及临床经验十分丰富的核心专家。
设备先进：专门的眼科医院通常会引进最先进的诊疗设备，如德国OCULUS眼表综合分析仪、visumax全飞秒手术系统、德国阿玛仕准分子激光、日本尼德克YAG激光、德国蔡司Humphrey视野仪等数十种医疗设备，以提高诊断和治疗的准确性和效果。
手术经验丰富：由于专门的眼科医院只进行眼部疾病方面的治疗，手术量大，医生的手术经验更为丰富，能够更好地处理各种复杂的个体差异，保证手术的安全性和效果。
服务更人性化：专门的眼科医院在服务方面往往更加注重患者的体验，提供更加个性化的服务。例如，挂号更方便，不存在挂不上号、排队难等问题；医生采取轮班休息制，周内到周末全不缺席，不存在实习生看诊；医生在面诊时都是一对一会诊，最大程度保护患者的隐私。
三甲医院
综合实力强：三甲医院是综合性医院，科室设置齐全，技术水平较为均衡，能够提供全面的医疗服务。在眼科方面，三甲医院也拥有专业的医生团队和先进的设备，能够诊治各种常见和疑难的眼科疾病。
科研教学资源丰富：三甲医院通常依托大学的科研和教学资源，在眼科的医疗技术和人才培养方面有着得天独厚的条件。例如，浙大附属的医院在眼科疾病的诊断和治疗方面有着很多成功的案例，并且在眼科科研方面也有着重要的贡献。
医保报销政策完善：三甲医院的医保报销政策通常比较完善，能够减轻患者的经济负担。例如，一些昂贵的药物和治疗项目在三甲医院可以报销，而在部分私立眼科医院可能需要自费。
如何选择
根据疾病类型选择：如果患者患有常见的眼科疾病，如近视、远视、散光、白内障、青光眼等，三甲医院和专门的眼科医院都可以提供良好的治疗。但如果患者患有复杂或罕见的眼科疾病，专门的眼科医院可能在诊断和治疗方面更具优势。
根据医生团队选择：患者可以了解医院的医生团队，包括医生的资质、经验、擅长领域等。例如，如果患者需要进行近视手术，可以选择在屈光手术方面有丰富经验的医生所在的医院。
根据设备条件选择：先进的医疗设备对于眼科疾病的诊断和治疗非常重要。患者可以了解医院的设备条件，选择设备先进、齐全的医院。
根据服务质量选择：患者可以参考其他患者的评价，了解医院的服务质量，包括挂号、就诊、手术、术后随访等环节。选择服务更人性化、能够提供良好就医体验的医院。