合作医疗与医保的主要区别体现在以下几个方面：
- 参保对象 ：
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合作医疗 ：主要针对农村户口的居民，且必须以家庭为单位整户参加。
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医保 ：包括城镇职工基本医疗保险、新型农村合作医疗、城镇居民基本医疗保险和商业医疗保险。其中，城镇职工基本医疗保险主要针对城镇职工，而城镇居民基本医疗保险和新型农村合作医疗分别针对城镇居民和农村居民。
- 缴费方式 ：
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合作医疗 ：农民自愿参加，每年需要办理参保缴费手续，缴费标准较低，且通常由农户自己承担。
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医保 ：
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职工医保 ：由用人单位和个人共同缴纳，缴费标准与个人工资和当地平均工资挂钩。
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居民医保 ：由个人和政府共同缴纳，缴费标准通常较低。
- 保障范围与待遇 ：
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合作医疗 ：保障范围较广，但保障水平相对较低，主要用于大病统筹。
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医保 ：保障范围更广，包括住院费用报销、门诊费用报销、个人账户待遇等，且报销比例相对较高。
- 持续性 ：
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合作医疗 ：通常是一年一缴费，交一年保一年。
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医保 ：特别是职工医保，要求持续缴纳一定年限（通常为15年）才可以享受终身医保待遇。
综上所述，合作医疗和医保在参保对象、缴费方式、保障范围与待遇以及持续性等方面存在明显差异。合作医疗主要针对农村户口居民，缴费较低，保障水平相对较低；而医保则覆盖更广泛的人群，包括城镇职工和居民，缴费较高，保障水平也更高。建议根据自身情况选择合适的医疗保险类型，以确保获得充分的医疗保障。