根据最新的信息，北京中医药大学医院在全国的排名如下：

1. 中国中医科学院广安门医院 ：全国综合排名第1。

2. 首都医科大学附属北京中医医院 ：全国综合排名第3。

3. 北京中医药大学东直门医院 ：全国综合排名第6。

4. 中国中医科学院西苑医院 ：全国综合排名第10。

5. 北京中医药大学东方医院 ：具体排名未提及，但被认为有专业的中医医护团队和丰富的临床经验。

6. 中国中医科学院望京医院 ：具体排名未提及，但在中医特色治疗方面有独特优势。

7. 北京中医药大学第三附属医院 ：具体排名未提及，但在多个专科领域积极开展中医诊疗工作。

建议：

• 中国中医科学院广安门医院 和 首都医科大学附属北京中医医院 在全国中医医院中排名前三，具有非常高的专业水平和综合实力，是患者选择中医治疗的首选。

• 北京中医药大学东直门医院 自2016年参评以来，连续8年荣获全国中医医院100强前十名，其竞争力和影响力不容小觑。

• 中国中医科学院西苑医院 和 北京中医药大学东方医院 也具备较高的专业水平，尤其在某些专科领域有显著优势。

• 中国中医科学院望京医院 和 北京中医药大学第三附属医院 也值得关注，它们在中医特色治疗和多个专科领域有不错的表现。