在手机上停农村合作医疗的方法如下：
- 通过微信操作 ：
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打开手机上的微信，点击“我”。
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点击“支付”选项进入。
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找到“生活缴费”并点击进入。
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在页面右侧点击“下箭头”进入。
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切换到自己的城市，点击“社保医保”进入。
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选择“医疗保险”，输入身份证号，勾选“同意服务协议”。
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点击“停止缴费信息”，进行停止即可。
- 通过支付宝操作 ：
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打开手机上的支付宝，进入“我的”或“个人中心”页面。
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找到“健康”或“医疗”等相关的选项，点击进入。
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在健康或医疗页面中，找到“农村合作医疗”或“合作医疗”等相关选项，点击进入。
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找到“取消”或“退保”等相关选项，点击进入。
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根据页面提示，填写相关信息和申请理由等，提交申请。
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等待相关部门审核和处理，根据提示进行后续操作。
- 通过当地社保局官方APP操作 ：
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下载并安装当地社保局提供的官方APP。
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登录APP，找到“医保”或“社会保险”等相关选项。
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选择“停保”或“报停”选项，按照提示填写个人信息和报停原因。
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提交申请，等待审核通过。
- 通过电话或邮件操作 ：
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联系当地社保局，电话或邮件形式说明注销意图。
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填写相关申请表格，详细填写个人信息及注销原因。
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提交申请表格，等待相关部门的审核。
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审核通过后，收到相关部门的通知，说明注销成功。
请根据您所在地区的具体情况和操作习惯，选择最适合您的方法进行操作。