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合作医疗（新型农村合作医疗）的参保人员在符合条件的情况下，是可以通过刷医保卡进行报销的 。具体报销流程和条件如下：
- 异地就医 ：
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参保人员需要先到参保地医保中心提出异地就医申请，并领取审批表，在异地医保定点医院的医保办公室盖章。
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若参保地与就医地实现了医保联网结算，参保人员可以直接在就医地刷医保卡就医，医疗费用将直接结算。
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特殊情况不能在就医地直接结算的，需开具相关说明，回到参保地报销。
- 本地就医 ：
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参保人员在定点医疗机构就诊时，可以直接凭借医保卡或身份证进行挂号和结算，系统会自动计算报销金额，参保人只需支付个人自付部分。
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在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构以及区内及区外市内定点医疗机构住院时，参保人可以在出院结帐时直接刷卡报销。
- 报销比例和内容 ：
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报销比例和内容根据各省份规定可能有所不同，需按照参保地的具体政策执行。
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符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，可以由基本医疗保险基金进行报销。
综上所述，合作医疗的参保人员在符合条件的情况下，是可以通过刷医保卡进行报销的。具体报销流程和条件需要根据当地政策和实际情况进行操作。建议参保人员提前了解当地医保政策，确保报销过程顺利。