医保和合作医疗（新农合）的区别主要体现在以下几个方面：
- 对象不同 ：
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医保 ：主要针对城镇职工、城镇居民以及灵活就业人员。城镇职工医疗保险（职工医保）和城镇居民基本医疗保险（居民医保）是医保的两种主要形式。
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合作医疗 ：主要针对农村户口的民众，通常以家庭为单位整户参加。
- 收费不同 ：
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医保 ：缴费较高，通常由个人和所在单位共同缴纳。城镇职工医疗保险的缴费与个人工资和当地平均工资挂钩，而居民医保的缴费则是固定的金额。
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合作医疗 ：收费较低，主要由农民个人缴费，有时集体和政府也会提供资助。
- 保障不同 ：
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医保 ：保障性较高，覆盖范围广，报销比例和限额较高，且通常在指定医院或药店可以享受全额报销。
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合作医疗 ：保障相对较低，报销比例和限额较低，且通常需要到指定医疗机构才能享受报销。
- 缴费方式不同 ：
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医保 ：对于用人单位来说，具有强制性，必须为员工办理职工医保，且缴费通过工资扣除。灵活就业人员则需要自行缴纳部分费用。
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合作医疗 ：农民自愿参加，需要每年办理参保缴费手续，缴费标准各地有所不同。
- 包含项目不同 ：
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医保 ：除了医疗保险外，还包括养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险。
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合作医疗 ：只包含医疗保险。
- 退休年龄和待遇不同 ：
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医保 ：在达到退休年龄并满足当地医保退休年限要求后，可以终身享受免费医保待遇。
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合作医疗 ：没有退休政策，需要终身缴费。
综上所述，医保和合作医疗在覆盖对象、收费方式、保障水平、缴费主体和包含项目等方面存在明显差异。医保适用于城镇职工和居民，保障水平较高；而合作医疗主要针对农村人口，保障水平相对较低。建议根据自身情况选择合适的医疗保障方式。