职工保险和新农合（新型农村合作医疗保险）的主要区别体现在以下几个方面：
- 覆盖对象 ：
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职工医保 ：主要针对城镇的用人单位及其职工，包括党政机关、企事业单位、民营经济和个体工商业者的职工，以及灵活就业者。
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新农合 ：主要面向拥有农村户口的人群，个人交一部分，国家补助一部分。
- 缴费主体和方式 ：
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职工医保 ：由用人单位和职工共同承担，按月缴纳，个人缴纳2%，公司缴纳10%。
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新农合 ：由个人缴纳，政府补贴，按年缴纳，个人缴费标准约为每人每年350元，国家补贴610元，实际可享受960元的医保待遇。
- 缴费标准 ：
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职工医保 ：缴费金额与个人工资挂钩，整体缴费标准远高于新农合。
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新农合 ：缴费金额相对较低，每年缴费几百元。
- 报销比例和范围 ：
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职工医保 ：报销比例通常较高，覆盖门诊、住院和买药等医疗费用，设有个人账户，可用于支付医疗费用。
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新农合 ：报销比例相对较低，主要集中在住院医疗费用，门诊报销比例较低，且无个人账户。
- 参保年限 ：
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职工医保 ：男性交满25年，女性20年，退休后终身享受医保待遇。
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新农合 ：需要终身缴费，交1年保1年，80岁也要继续交。
- 其他待遇 ：
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职工医保 ：在缴纳一定年限后，退休职工即使不再缴费，也能享受医保保障。
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新农合 ：不存在终身医保的问题，需按年缴费。
综上所述，职工医保和新农合在覆盖对象、缴费主体和方式、缴费标准、报销比例和范围、参保年限等方面存在明显差异。职工医保的缴费较高，但报销比例和待遇也更好，适合城镇职工和退休人员；新农合的缴费较低，主要覆盖农村居民，报销比例和范围相对较低，适合农村户口的居民。建议有条件的话，尽量选择缴纳职工医保，以获得更全面的医疗保障。