重庆医科大学和泸州医学院（现西南医科大学）都是中国西南地区知名的医学院校，各有其优势。以下是它们的一些比较：
- 历史底蕴和知名度 ：
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重庆医科大学 ：创建于1956年，由上海第一医学院（复旦大学上海医学院）分迁来渝组建而成，原名重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校入选国家“111计划”、中西部高校基础能力建设工程、卓越医生教育培养计划等，是中国政府奖学金院校、来华留学示范基地暨来华学“211”院校、国家重点支持建设的西部地区十四所大学之一。
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泸州医学院 ：为四川省属普通本科高等院校，入选“卓越医生教育培养计划”、四川2011计划，是临床医学专业综合改革项目试点高校、四川省免费定向医生培养的高等院校。1993年，学校经国务院学位委员会批准成为硕士学位授权单位；2015年4月，更名为四川医科大学，2015年12月定名为西南医科大学。
- 学科建设和科研实力 ：
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重庆医科大学 ：在高水平学科数量（硕士点、博士点、博士后流动站）方面明显多于泸州医学院。重庆医科大学的内科学（传染病）、儿科学、神经病学、临床检验诊断学都是国家重点学科。
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泸州医学院 （西南医科大学）：在临床医学心血管方面、麻醉学、中西医临床医学相对比较好。
- 地理位置 ：
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重庆医科大学 ：位于重庆市，地理位置优越，交通便利，有利于学生的实习和就业。
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泸州医学院 （西南医科大学）：位于四川省泸州市，虽然地理位置相对偏远一些，但四川省的医疗资源丰富，也有一定的地域优势。
建议
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如果从历史底蕴、知名度和学科建设方面考虑 ，重庆医科大学更为优越，入选的国家项目和重点学科数量都多于泸州医学院。
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如果从地理位置和地域优势方面考虑 ，泸州医学院所在的四川省医疗资源丰富，且学校近年来发展迅速，更名为西南医科大学后，其影响力和认可度也有所提升。
综合来看，重庆医科大学在整体实力上更胜一筹，但泸州医学院也有其独特的优势。选择哪所学校更好，还需根据个人的职业规划、兴趣和需求来决定。