居民医保和合作医疗的主要区别如下：
- 服务对象不同 ：
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居民医保主要面向老人、儿童、在校学生、其他未成年人等。
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合作医疗主要面向农村居民、城镇居民、少年儿童、学生、老年人等。
- 缴纳金额不同 ：
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居民医保由个人缴费和政府补助构成，可以按年缴费，也可以一次性缴纳。
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合作医疗只缴纳个人费用，没有政府补助。
- 报销比例不同 ：
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居民医保一般按梯次报销，根据医院等级不同，报销比例也不同。
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合作医疗报销比例一般在60%到80%之间，某些特定情况下（如大病住院）报销比例最高可达90%。
- 缴纳费用方式不同 ：
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居民医保由个人缴费和政府补助构成。
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合作医疗由个人缴费和集体补助构成，没有政府补助。
- 保障待遇的侧重点不同 ：
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居民医保更侧重于体现互济性，即将分散的小钱集中起来治大病，建立了特定门诊慢性病和普通门诊慢性病报销制度。
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合作医疗（新型农村合作医疗保险）带有政府扶持、农民（家庭）合作的性质，政策设计上偏重于普惠制，例如在普通门诊统筹方面，个人虽然报销额度不多，但人人有份。
- 管理部门不同 ：
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城镇居民医保主要由人社部门管理。
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新农合多数地方由卫生部门管理。
- 覆盖人群不同 ：
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城镇居民医保主要覆盖城镇户籍的居民。
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新农合主要覆盖农村户籍居民。
综上所述，居民医保和合作医疗在服务对象、缴纳金额、报销比例、缴纳费用方式、保障待遇的侧重点、管理部门和覆盖人群等方面存在显著差异。建议根据自身情况选择合适的医保类型，以确保获得适当的医疗保障。