因单位交五险而需要停掉农村的合作医疗（新农合）医保，可以按照以下步骤操作：
- 携带必要材料 ：
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本人身份证原件及复印件。
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与单位签订的劳动合同或者本单位出具的工作证明。
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农村合作医疗证。
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户口簿（如有需要）。
- 到当地社保大厅或新农合办公室办理 ：
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前往当地社保大厅或新农合办公室，携带上述材料，办理农保终止手续。
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如果单纯想停掉而不缴纳费用，也可以直接办理。
- 由单位办理职工医保 ：
- 在办理完农保终止手续后，携带相关证明（如农保终止证明），由单位经办人员为其办理职工医保的参保手续。
- 线上办理（如适用） ：
- 可以下载国家医保服务平台APP，根据提示注册登录，选择历史缴纳过新农合的地区，点击“城乡居民暂停参保”，按照提示办理减员即可。
- 咨询当地社保中心或12333热线 ：
- 如果线上无法办理，可以拨打当地社保中心或12333热线的电话进行咨询，了解具体的办理流程和所需材料。
建议
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提前咨询 ：在办理停保手续前，建议先咨询当地社保中心或12333热线，了解具体的办理流程和所需材料，以确保办理过程顺利。
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保留相关凭证 ：在办理停保手续时，务必保留好所有相关凭证，以便后续需要时能够提供证明。
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确认权益 ：了解停保期间的权益变化，避免影响个人保障。