如果您不小心缴纳了两次合作医疗费用，想要申请退回多余的款项，可以按照以下步骤操作：
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准备必要材料 ：您需要准备个人的身份证及其复印件、银行卡复印件以及至少一份缴费凭证。如果是代办人办理，则还需要提供代办人的身份证复印件和委托书。
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选择退费途径 ：您可以选择线上或线下两种方式办理退费。
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线上途径 ：通过12366纳税服务应用进行咨询，根据客服的指引准备相关资料并通过办税大厅办理退费。
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线下途径 ：直接前往参保地的税务大厅或医保中心提交退费申请，并提交上述准备好的材料。
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线上 ：登录12366纳税服务应用，选择所在城市，进行在线咨询并提交所需资料。
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线下 ：携带所有材料到参保地的税务大厅或医保中心，填写相应的退费申请表。
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等待处理 ：提交申请后，相关部门会进行审核。审核通过后，会将多缴的费用退还到您的指定账户中。这个过程可能需要一定的时间，请耐心等待。
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注意事项 ：
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确保您提供的信息准确无误。
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保留好所有相关的缴费记录和凭证，以备不时之需。
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如果在不同地区重复参加了医保，需要先核实并确认重复缴费的情况，然后按照上述步骤申请退费。
请根据您的实际情况选择最便捷的退费途径，并确保遵循所有步骤完成退费申请。如果有任何疑问，建议直接联系当地医保部门或通过官方提供的联系方式进行咨询，以获得更准确的指导。