通过微信小程序缴纳农村合作医疗的步骤如下：

1. 打开微信并进入支付页面：首先，在手机上打开微信应用程序，点击屏幕右下角的“我”选项，进入个人页面后，点击“支付”按钮，进入支付页面。

2. 找到城市服务或生活服务：在支付页面中，查找“城市服务”或“生活服务”板块。不同版本的微信，其位置可能略有差异，但一般都能在该页面找到。

3. 搜索并进入农村合作医疗缴纳服务：进入城市服务或生活服务后，在搜索栏中输入“农村合作医疗”或相关关键词，如“城乡居民医疗保险”等。点击搜索后，在搜索结果中找到农村合作医疗缴纳的相关服务，点击进入。

4. 填写参保人信息：按照页面提示，准确输入参保人的相关信息，如身份证号码、姓名等。这些信息的准确性至关重要，直接关系到缴费的正确性和参保人的权益。务必仔细核对，确保无误。

5. 选择缴费年份和金额：确认参保人信息无误后，选择需要缴纳的年份和对应的缴费金额。通常，农村合作医疗保险是按年缴纳，不同地区可能有不同的缴费标准和档次，可根据自身情况选择。

6. 完成支付：选择好缴费年份和金额后，点击“支付”按钮，选择微信支付的常用支付方式，如零钱、银行卡等，完成缴费操作。支付成功后，系统会提示缴费成功的信息，同时可能会发送缴费成功的通知短信。

建议：在缴费前，请确保已安装微信APP并登录个人账号，准备好需要缴纳的相关信息，以节省时间并避免操作失误。