农村合疗（新型农村合作医疗）和农村社保（社会保险）之间存在以下主要区别：
- 参保对象不同 ：
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农村合疗的参保对象是农村户口的农村居民，通常需要每年一次性支付当年所有保费，且必须当年缴费次年才能享受待遇。
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农村社保的参保对象是在职职工或城镇居民，对于在职职工而言，社保是强制性的，必须缴纳。
- 缴费方式不同 ：
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农村合疗采取个人缴费为主，国家给予一定补贴的方式，缴费金额每年在特定时间内一次性支付。
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农村社保的缴费由用人单位和职工共同承担，按照规定的缴费基数和比例按月缴纳。
- 保障力度不同 ：
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农村合疗由于是多方筹资，保障力度相对较低，基金有限。
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农村社保实行“低水平、广覆盖”的特点，一经参保，享受的标准是统一且较为全面的。
- 待遇不同 ：
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农村合疗主要针对医疗费用进行报销，报销比例相对较低，且多数情况下只能在住院时使用，少部分地方门诊也能报销。
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农村社保包含医疗保险、养老保险、工伤保险、失业保险和生育保险等多个方面，为职工提供更为全面的保障，且医疗保险的报销比例较高，使用范围也更广泛。
- 参保年限不同 ：
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农村合疗需要每年续交保费，没有设定具体的参保年限，需终身缴费。
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农村社保中的医疗保险要求持续缴纳最少15年才可以享受终身医保待遇，而养老保险需要连续缴纳满15年。
- 基金筹集与管理 ：
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农村合疗基金由个人缴费、集体扶持和政府资助相结合。
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农村社保基金由用人单位和职工共同缴纳，同时国家也会根据规定进行补贴。
综上所述，农村合疗和农村社保在参保对象、缴费方式、保障力度、待遇、参保年限以及基金筹集与管理等方面均有显著差异。建议根据自身情况选择合适的保险类型，以确保获得适当的医疗保障和福利。